生物医学研究论文常用软件推荐及理由

必学：1、计算机基础（linux+perl+R 或者 python+matlab）2、生信基础知识（测序+数据库+数据格式）3、生信研究领域（全基因组，全转录组，全外显子组，捕获目标区域测序）4、生信应用领域（肿瘤筛查，产前诊断，流行病学，个性化医疗）分而治之：一、计算机基础，需要看三本书，一步步的学会学通，不需要刻意去找哪个书，一般linux是鸟哥私房菜，perl是小骆驼咯，R是R in action，但是看一本书只能入门，真正想成为菜鸟，必须每个要看五本书以上！我云盘里面有这基本上的高清打印版，大家可以去淘宝打印一下才几十块钱还包邮，对书比较讲究的也可以买正版，也不过是一百多块钱而已！二、生信基础知识，测序方面，在百度文库找十几篇一代二代三代测序仪资料仔细研读，然后去优酷下载各大主流测序仪的动画讲解，再看看陈巍学基因的讲解；数据库先看看三大主流数据库——NCBI，ENSEMBL，UCSC，还有一些也可以了解一些（uniprot，IMGT，KEGG，OMIN，TIGR，GO）同样也是百度文库自己搜索资料，但是这次需要自己去官网一个个页面点击看，一个个翻译成中文理解吃透；数据格式讲起了就多了，这个主要是在项目流程中慢慢学，或者你有机会去上课，不然你看来也是立马忘记的，主要有sam，vcf，fasta，fastq，bed，gtf，gff，genbank，ensembl，psl等等三、生信研究领域，各个领域主要是软件繁多，合起来常用的估计有上百个软件了，一般只有从业五六年以上的人才有可能把它们全部用过一遍，而且这也完全需要项目来训练，而不能仅仅是看看软件手册，但是研究领域最重要的是背后的原理，需要看各大牛的综述。a) 生信基础软件(blast++套件，fastqc，flash，blast，solexaQA，NGS-QC-toolkit，SRA-toolkit，fastx-toolkit)b) snp-calling相关软件（bwa，bowtie，samtools，GATK，VarSjar，annovar）c) 基因组相关软件（velvet，SOAPdenovo2，repeatmasker，repeatscount，piler，orthMCL，inparanoid，clustw，muscle，MAFFT，quickparanoid，blast2go，RAxML，phyML）d) 转录组相关软件（trinity，tophat，cufflinks，RseQC，RNAseq，GOseq，MISO，RSEM，khmer，screed，trimmomatic，transDecoder，vast-tools，picard-tools，htseq，cuffdiff，edgeR，DEseq，funnet，davidgo，wego，kobas，KEGG，Amigo，go）

推荐第一个：3Dbody解剖，上解剖课必备神器；第二个：丁香园，学习讨论社区，有问题可以上去问问；第三个：YaYa医师，经验派教学代表，一流医院一线输出的教学内容，就冲这含金量可以多学学;第四个:医题库，考试看题/练习习题随身必备，不多说考试党强烈推荐;第五个:心电图普、轻盈医学等等

文字处理系列word：是进行论文综述写作的必备软件，用得好可以单独应用它实现整个论文的写作，包括插入图片，参考文献的引用等。这个不多介绍。powerpoint：开题报告，论文答辩，大会小会发言，宣传自己作品，这个软件最好不过了，它可以查入动画，声音，视频等演示文件，增加您的说服力。可以在网上找个教程自己来学 excel：电子表格，有简单的统计功能，作统计图表很方便，输入数据就可以生成标准的统计图表，方便在word里引用。还可以用它作记帐本呀，我就是这样，把实验费用都记在这里，可以随时统计金额。 onenote：这个在office2003里有，相当于记事本，但功能比记事本强大得多，可以插入图片，表格等。字典工具：当然是金叶公司的产品了，这是专业的医学软件制作公司，最早出的网际金典相信很多朋友都用过吧新编全医药学大词典，对于医学生来说，这个词典比金山词霸要好很多，可以翻译出很专业的医学词组，词汇量极大医师用药参考：提供专业的用药参考，包括药物的相互作用，禁忌等统计软件用spss或sas都得啊，这可是论文中统计分析必不可少的哦。0有中文版的，但是很大，有6CD，4G，安装后也很大，spss占用空间比较小，100M左右。参考文献管理软件：ference manager，推荐使用，它和 endnote都是isi公司的产品，但我个人认为RM比endnote好用，新出的0支持中文，但常出问题，不知是***的原因还是软件本身的bug，但RM就很少出问题。外文的参考文献用它的规范可以做得很标准。2医学文献王：这是金叶公司11推出的国内首款个人参考文献管理软件，对中文献的支持绝对比任何软件都好，但第一次做这种软件，仍有很多细节没处理好，不久将升级，让我们拭目以待吧。图片处理软件：抓图软件如 hypersnap-DX，snagit等都不错，可以截取任意图片的任意部分，这个在做幻灯是特别有用。处理软件一般就用photoshop，学得好可以做出很多漂亮图片来。image pro是一个专业的图像分析软件，可以分析各种医学图片，如免疫组化，一般只能定性，用它分析后可以定量。浏览软件adode ，现在已有0的正式版了，这时浏览外文文献的必备工具，可以在上面作简单标记。国内的就是vip和caj的浏览器了，用来看vip和 cnki和全文。专业软件 1：序列分析软件DNAMANDNAMAN是一种常用的核酸序列分析软件。由于它功能强大，使用方便，已成为一种普遍使用的DNA序列分析工具。2质粒绘图的专业软件Winplas作为一个质粒绘图的专业软件，功能强大，而且极易上手，它可以绘制出具有发表质量的质粒图谱。可广范应用于论文、教程的质粒插图，它的特性包括：无论是否知道质粒的原始序列都能绘制质粒图，像Vector NTI等综合软件也能绘制质粒图，但有一个前提就是首先得知道质粒得原始序列；可读入各种流行得序列格式文件，能方便地导入各种序列信息；可自动在识别序列中的限制性酶切位点；可对序列进行各种编辑，如：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列删除等绘图功能强大，如：位点标签、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形质粒图谱，可输出到剪贴板或图像文件。3数字影像读片软件－DISC或OSIRIS，用于读x 片及CT片等，没用过，只听说过。 4 Gdicom医学图像浏览器Ⅰ 0:医学Dicom格式图像文件浏览器软件，是中国医学共享网又一软件，能浏览及加工标准DICOM接口下文件，别存为JPG，BMP格式文件，能测量长度及角度等等

丁香客丁香客是丁香园旗下的一款产品。丁香园是面向医生这个群体的网站，据说有270万医生会员（占中国医生数量一半以上），其中超过70%的会员拥有硕士或博士学位，是中国医学网站与论坛的老大。丁香客可以查看动态、发布观点、上传图片、浏览文章、发布信息，是为医生群体提供专业知识交流的社交工具，适合医生及在校医学生使用。医维度医维度3d人体解剖app这个软件是一个提供三维画面人体解刨模型的免费软件，这个软件主要是为医学生以及专业的医疗人士提供的帮助服务软件，通过医维度人体解剖app你可以清晰的看到各种人体解刨动画，灵活控制3D模型，可以360度任意角度旋转、放大缩小察看，随时显示、隐藏、透明处理人体结构的任意一部分。这一款APP可以将繁琐的解剖学内容立体呈现，细致而准确，被称作最好的解剖学APP，可谓是学习解剖的神兵利器。用药助手用药助手也是丁香园旗下一款面向医生群体的APP，它可以用来查询药品说明书、查看用药指南及进行常用医学计算。它对临床医生及在校大学生（尤其是药学专业大学生）十分大！杏树林医学文献医学文献APP是杏树林旗下的一款产品。杏树林医学文献是国内首个个性化的医学专业文献手机应用。它囊括全球影响力最高的50多本医学杂志，包括新英格兰医学杂志（NEJM）、美国医学会杂志（JAMA）、柳叶刀杂志（Lancet）、英国医学杂志（BMJ）和中华医学会各科杂志等，覆盖超过20个专科。它对医务工作者及在校医学生的学习和科研有着巨大的帮助！（阅读专业论文对医学英语的要求非常高，所以医学生们一定要好好学习专业英语）医景MedscapeMedscape是美国医疗健康服务网站WebMD旗下医景网的一款APP。其内容包括新闻资讯、药物配伍禁忌、治疗指南、医学计算器、医学培训等方面。Medscape是互联网上最大的免费提供临床医学全文文献和继续医学教育资源(CME)的网点。PubMed On Tap数据库APP，PubMed提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要，其数据库来源包括MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher，核心主题为医学，亦包括其他与医学相关的领域，例如护理学等。是进行生物医学研究的必备神器！iRadiology医学影像学APP，内容丰富，每张片子都有标注讲解，简单易懂（当然，你要能看懂这些专业的医学英语）。除了医学app排行榜前十名，还有很多很多非常好的医学APP，例如医学时间、全科医生、PCI病例荟、骨科时间、AO surgery、plos reader等等，另外很多医学APP都是全英文的，因此一款电子词典APP也是必不可少的（当然最好能精通医学英语）！

医学论文常用软件推荐及理由

最常用的是spss，因为spss窗口操作非常方便简单，医学生一般来说统计不是很强，也没有太多时间来学习其他的复杂的统计软件。很多医科院校的统计课程会教授使用spss或者sas软件，现在第6版（记不大清了）的医学统计学用了很大的篇幅来教授spss的使用，足见其对医学生的意义。还有很多用excel来作图或作统计分析的。

医学生最好掌握的计算机软件文字处理系列，即office系列了word：是进行论文综述写作的必备软件，用得好可以单独应用它实现整个论文的写作，包括插入图片，参考文献的引用等。这个不多介绍。powerpoint：开题报告，论文答辩，大会小会发言，宣传自己作品，这个软件最好不过了，它可以查入动画，声音，视频等演示文件，增加您的说服力。可以在网上找个教程自己来学excel：电子表格，有简单的统计功能，作统计图表很方便，输入数据就可以生成标准的统计图表，方便在word里引用。还可以用它作记帐本呀，我就是这样，把实验费用都记在这里，可以随时统计金额。onenote：这个在office2003里有，相当于记事本，但功能比记事本强大得多，可以插入图片，表格等。字典工具：当然是金叶公司的产品了，这是专业的医学软件制作公司，最早出的网际金典相信很多朋友都用过吧新编全医药学大词典，对于医学生来说，这个词典比金山词霸要好很多，可以翻译出很专业的医学词组，词汇量极大医师用药参考：提供专业的用药参考，包括药物的相互作用，禁忌等统计软件用spss或sas都得啊，这可是论文中统计分析必不可少的哦。0有中文版的，但是很大，有6CD，4G，安装后也很大，spss占用空间比较小，100M左右，0版我看到过中文版的，但不支持sp2，这些软件可以在网上找找。参考文献管理软件：ference manager，推荐使用，它和 endnote都是isi公司的产品，但我个人认为RM比endnote好用，新出的0支持中文，但常出问题，不知是破解的原因还是软件本身的bug，但RM就很少出问题。外文的参考文献用它的规范可以做得很标准。2医学文献王：这是金叶公司11推出的国内首款个人参考文献管理软件，对中文献的支持绝对比任何软件都好，但第一次做这种软件，仍有很多细节没处理好，不久将升级，让我们拭目以待吧。图片处理软件：抓图软件如 hypersnap-DX，snagit等都不错，可以截取任意图片的任意部分，这个在做幻灯是特别有用。处理软件一般就用photoshop，学得好可以做出很多漂亮图片来。image pro是一个专业的图像分析软件，可以分析各种医学图片，如免疫组化，一般只能定性，用它分析后可以定量。浏览软件adode 0 0，现在已有0的正式版了，这时浏览外文文献的必备工具，可以在上面作简单标记。国内的就是vip和caj的浏览器了，用来看vip和 cnki和全文。专业软件1：序列分析软件DNAMANDNAMAN是一种常用的核酸序列分析软件。由于它功能强大，使用方便，已成为一种普遍使用的DNA序列分析工具。2质粒绘图的专业软件Winplas作为一个质粒绘图的专业软件，功能强大，而且极易上手，它可以绘制出具有发表质量的质粒图谱。可广范应用于论文、教程的质粒插图，它的特性包括：无论是否知道质粒的原始序列都能绘制质粒图，像Vector NTI等综合软件也能绘制质粒图，但有一个前提就是首先得知道质粒得原始序列；可读入各种流行得序列格式文件，能方便地导入各种序列信息；可自动在识别序列中的限制性酶切位点；可对序列进行各种编辑，如：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列删除等绘图功能强大，如：位点标签、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形质粒图谱，可输出到剪贴板或图像文件。3数字影像读片软件－DISC或OSIRIS，用于读x 片及CT片等，没用过，只听说过。4 Gdicom医学图像浏览器Ⅰ 0: 医学Dicom格式图像文件浏览器软件，是中国医学共享网又一软件，能浏览及加工标准DICOM接口下文件，别存为JPG，BMP格式文件，能测量长度及角度等等

医学导航，医学百科，

同感，不管是本科、研究生或者是博士，医学生的论文都是一大难关，特别是开题。然而选题路漫漫，从茫茫科研文献和临床问题中找研究方向，头秃了很久，却迟迟无法定下来。无奈只好求助同为医生的我哥，他扔了一个他们医院的临床精钥app，里面有关于如何选题的内容，或者你也可以试试。

生物医学研究论文常用软件推荐

spss，sas等统计学软件及基本的PS软件

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生物医学研究论文常用软件推荐知乎

考试100啊，这里面有大量医学类证书考试的题库

知网中国生物医学数据库 pubmed 都不错，但都是收费的数据库，没买所有的数据库时不能下载部分文章。谷歌免费的信息不会完整被下载。

SPSS 是社科类绘图软件，它的很多功能并不适合理工科使用，虽然新版SPSS是为所有专业研发的，但由于历史传承，还是不适合理工科使用。特别是当绘图比较复杂的时候，origin的优势就显示出来了。SPSS适合那种，行列特别多的数据分析。，

论文数据分析常用软件推荐及理由

不知道你需要分析的数据类型和你要的结果是什么，所以推荐也不好推荐，当前用的最多的是excel，基本一般的企业足够使用了。如果需要一些相关性分析比较多的，推荐用SPSS软件。满意请采纳！

数据分析软件有Excel、SAS、R、SPSS、Tableau Software。1、Excel为Excel微软办公套装软件的一个重要的组成部分，它可以进行各种数据的处理、统计分析和辅助决策操作，广泛地应用于管理、统计财经、金融等众多领域。2、SASSAS由美国NORTH CAROLINA州立大学1966年开发的统计分析软件。SAS把数据存取、管理、分析和展现有机地融为一体。SAS提供了从基本统计数的计算到各种试验设计的方差分析，相关回归分析以及多变数分析的多种统计分析过程，几乎囊括了所有最新分析方法。3、RR拥有一套完整的数据处理、计算和制图功能。可操纵数据的输入和输出，可实现分支、循环，用户可自定义功能。4、SPSSSPSS除了数据录入及部分命令程序等少数输入工作需要键盘键入外，大多数操作可通过鼠标拖曳、点击“菜单”、“按钮”和“对话框”来完成。5、Tableau SoftwareTableau Software用来快速分析、可视化并分享信息。Tableau Desktop 是基于斯坦福大学突破性技术的软件应用程序。它可以以在几分钟内生成美观的图表、坐标图、仪表盘与报告。

数据分析的基础是数据管理。有款叫蓝点通用管理系统的软件，可由用户自定义实现各种数据管理功能，简单灵活，且数据统计分析很直观方便。

我推荐一些常用的大数据分析工具专业的大数据分析工具各种Python数据可视化第三方库其它语言的数据可视化框架一、专业的大数据分析工具1、FineReportFineReport是一款纯Java编写的、集数据展示(报表)和数据录入(表单)功能于一身的企业级web报表工具，只需要简单的拖拽操作便可以设计复杂的中国式报表，搭建数据决策分析系统。2、FineBIFineBI是新一代自助大数据分析的商业智能产品，提供了从数据准备、自助数据处理、数据分析与挖掘、数据可视化于一体的完整解决方案，也是我比较推崇的可视化工具之一。FineBI的使用感同Tableau类似，都主张可视化的探索性分析，有点像加强版的数据透视表。上手简单，可视化库丰富。可以充当数据报表的门户，也可以充当各业务分析的平台。二、Python的数据可视化第三方库Python正慢慢地成为数据分析、数据挖掘领域的主流语言之一。在Python的生态里，很多开发者们提供了非常丰富的、用于各种场景的数据可视化第三方库。这些第三方库可以让我们结合Python语言绘制出漂亮的图表。1、pyechartsEcharts(下面会提到)是一个开源免费的javascript数据可视化库，它让我们可以轻松地绘制专业的商业数据图表。当Python遇上了Echarts，pyecharts便诞生了，它是由chenjiandongx等一群开发者维护的Echarts Python接口，让我们可以通过Python语言绘制出各种Echarts图表。2、BokehBokeh是一款基于Python的交互式数据可视化工具，它提供了优雅简洁的方法来绘制各种各样的图形，可以高性能的可视化大型数据集以及流数据，帮助我们制作交互式图表、可视化仪表板等。三、其他数据可视化工具1、Echarts前面说过了，Echarts是一个开源免费的javascript数据可视化库，它让我们可以轻松地绘制专业的商业数据图表。大家都知道去年春节以及近期央视大规划报道的百度大数据产品，如百度迁徙、百度司南、百度大数据预测等等，这些产品的数据可视化均是通过ECharts来实现的。2、D3D3（Data Driven Documents）是支持SVG渲染的另一种JavaScript库。但是D3能够提供大量线性图和条形图之外的复杂图表样式，例如Voronoi图、树形图、圆形集群和单词云等。