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必学：1、计算机基础（linux+perl+R 或者 python+matlab）2、生信基础知识（测序+数据库+数据格式）3、生信研究领域（全基因组，全转录组，全外显子组，捕获目标区域测序）4、生信应用领域（肿瘤筛查，产前诊断，流行病学，个性化医疗）分而治之：一、计算机基础，需要看三本书，一步步的学会学通，不需要刻意去找哪个书，一般linux是鸟哥私房菜，perl是小骆驼咯，R是R in action，但是看一本书只能入门，真正想成为菜鸟，必须每个要看五本书以上！我云盘里面有这基本上的高清打印版，大家可以去淘宝打印一下才几十块钱还包邮，对书比较讲究的也可以买正版，也不过是一百多块钱而已！二、生信基础知识，测序方面，在百度文库找十几篇一代二代三代测序仪资料仔细研读，然后去优酷下载各大主流测序仪的动画讲解，再看看陈巍学基因的讲解；数据库先看看三大主流数据库——NCBI，ENSEMBL，UCSC，还有一些也可以了解一些（uniprot，IMGT，KEGG，OMIN，TIGR，GO）同样也是百度文库自己搜索资料，但是这次需要自己去官网一个个页面点击看，一个个翻译成中文理解吃透；数据格式讲起了就多了，这个主要是在项目流程中慢慢学，或者你有机会去上课，不然你看来也是立马忘记的，主要有sam，vcf，fasta，fastq，bed，gtf，gff，genbank，ensembl，psl等等三、生信研究领域，各个领域主要是软件繁多，合起来常用的估计有上百个软件了，一般只有从业五六年以上的人才有可能把它们全部用过一遍，而且这也完全需要项目来训练，而不能仅仅是看看软件手册，但是研究领域最重要的是背后的原理，需要看各大牛的综述。a) 生信基础软件(blast++套件，fastqc，flash，blast，solexaQA，NGS-QC-toolkit，SRA-toolkit，fastx-toolkit)b) snp-calling相关软件（bwa，bowtie，samtools，GATK，VarSjar，annovar）c) 基因组相关软件（velvet，SOAPdenovo2，repeatmasker，repeatscount，piler，orthMCL，inparanoid，clustw，muscle，MAFFT，quickparanoid，blast2go，RAxML，phyML）d) 转录组相关软件（trinity，tophat，cufflinks，RseQC，RNAseq，GOseq，MISO，RSEM，khmer，screed，trimmomatic，transDecoder，vast-tools，picard-tools，htseq，cuffdiff，edgeR，DEseq，funnet，davidgo，wego，kobas，KEGG，Amigo，go）

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丁香客丁香客是丁香园旗下的一款产品。丁香园是面向医生这个群体的网站，据说有270万医生会员（占中国医生数量一半以上），其中超过70%的会员拥有硕士或博士学位，是中国医学网站与论坛的老大。丁香客可以查看动态、发布观点、上传图片、浏览文章、发布信息，是为医生群体提供专业知识交流的社交工具，适合医生及在校医学生使用。医维度医维度3d人体解剖app这个软件是一个提供三维画面人体解刨模型的免费软件，这个软件主要是为医学生以及专业的医疗人士提供的帮助服务软件，通过医维度人体解剖app你可以清晰的看到各种人体解刨动画，灵活控制3D模型，可以360度任意角度旋转、放大缩小察看，随时显示、隐藏、透明处理人体结构的任意一部分。这一款APP可以将繁琐的解剖学内容立体呈现，细致而准确，被称作最好的解剖学APP，可谓是学习解剖的神兵利器。用药助手用药助手也是丁香园旗下一款面向医生群体的APP，它可以用来查询药品说明书、查看用药指南及进行常用医学计算。它对临床医生及在校大学生（尤其是药学专业大学生）十分大！杏树林医学文献医学文献APP是杏树林旗下的一款产品。杏树林医学文献是国内首个个性化的医学专业文献手机应用。它囊括全球影响力最高的50多本医学杂志，包括新英格兰医学杂志（NEJM）、美国医学会杂志（JAMA）、柳叶刀杂志（Lancet）、英国医学杂志（BMJ）和中华医学会各科杂志等，覆盖超过20个专科。它对医务工作者及在校医学生的学习和科研有着巨大的帮助！（阅读专业论文对医学英语的要求非常高，所以医学生们一定要好好学习专业英语）医景MedscapeMedscape是美国医疗健康服务网站WebMD旗下医景网的一款APP。其内容包括新闻资讯、药物配伍禁忌、治疗指南、医学计算器、医学培训等方面。Medscape是互联网上最大的免费提供临床医学全文文献和继续医学教育资源(CME)的网点。PubMed On Tap数据库APP，PubMed提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要，其数据库来源包括MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher，核心主题为医学，亦包括其他与医学相关的领域，例如护理学等。是进行生物医学研究的必备神器！iRadiology医学影像学APP，内容丰富，每张片子都有标注讲解，简单易懂（当然，你要能看懂这些专业的医学英语）。除了医学app排行榜前十名，还有很多很多非常好的医学APP，例如医学时间、全科医生、PCI病例荟、骨科时间、AO surgery、plos reader等等，另外很多医学APP都是全英文的，因此一款电子词典APP也是必不可少的（当然最好能精通医学英语）！

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proofreading其实我本科的时候就已经开始用proofreading了。但是因为本科的论文压力并没有很大，所以并不能完全体会它有多香，直到上了研究生。硕士刚开始的时候，能深切的感受到压力。有的时候越有压力，却越容易犯懒拖延，一犯懒就导致各种论文写的很仓促，仓促之下各种语法错误、用词准确度、时态、句式逻辑等这些问题就都不受控制地露出马脚。这个时候我一般会去选择把写好的论文拿去交给Proofreading的专业顾问老师，根据他们的批注和意见进行反思和修改。Zotero这款文献管理软件真的要吹爆它！它不仅可以对文献进行分类还能够将中英文的文献西东倒入论文。除此之外，你还可以做笔记，做标签，简直不要太爽！Grammarly最让人头疼的语法问题也有救啦！只要电脑上下载一个插件，或者在google上安装一个插件就可以了。当你在文档上输入的时候，如果有语法问题他会自动标红。当然有些还不是特别的准确。 Quillbot在提交论文之前，相似度是最让人头疼的。大多数学校会把相似度高判定为抄袭！！！Quillbot可以完全解决这类问题。不需要注册，直接搜索，并且将你需要替换的内容复制粘贴到文本框里，他就能直接跳出可以替换的单词或者短语！并且它本身也是有查重的功能哦！快来一起试试吧！

常用办公软件WORD，金山WPS都可以。供参考！

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