论文投稿百科

生物信息学实验论文难写吗

发布时间:2024-07-04 14:58:55

生物信息学实验论文难写吗

应该可以吧。。。

不知道,生物信息学,比较难

哪个专业的博士大论文都不好完成,需要好几个创新点的。但是以我做生信的经验,生信方向只要有系统的做,就很容易完成大论文。有系统的做是你一直做一个方向,用不同的方法研究一个内容,而不是一会研究蛋白质一会研究RNA这样跳来跳去的。

生物信息学论文好写吗

(1)在公共DNA数据库(比如GenBank)中有多少玉米相关的条目(entries)?在数据库中与玉米相关数据中有多少Waxy (granule-bound starch synthase)基因序列?(2)SSH实验得到了一个未知序列,请在公共数据库中找到最佳匹配(hit)(其实就是做比对,blast),然后预测潜在的功能。(结构相似性与功能相似性)(3)用动态算法(指定了这个算法:Needleman-Wunsch algorithm)对以下序列进行全局比对,打分系统用BLOSUM50空位罚分8。(需要你去了解这个算法,然后用程序实现应用到比对中,最后得出最佳的匹案得到结果)(4) 在竹子的基因组片段中找基因(5) 在植物抗病基因中找一致性序列(domains/motifs)(这个你可以用寻找motif的工具,如MEME)(6) 构建植物抗病基因的系统发生树(7) 写一篇近两年关于谷物类基因或者人类基因组相关的综述。. LZ你这个是课程结束作业么,工作量不小啊

你这个问题好大,生物信息学包含的内容太多,主要看你需要做哪些分析,是想学习分析,还是只是需要发表论文,如果学习,那是一个系统的学习,推荐学习两门语言,R语言和PERL语言,学习两个数据库,GEO和TCGA,这两个数据库是现在的主流,需要掌握的。学习资源可以取生信自学wang和丁香园,都可以学到不少东西。如果是写论文,可以直接找生信分析的人,把分析好的数据和图片给你,你就可以写论文了,当然找人家做一般都是有偿的。

最好先阅读几篇相应文章和相今似的论文,比如你的课题是油菜,你可以搜有关其他物种如小麦的。根据论文写作步骤制定实验计划。要练习使用一些常用软件,如NCBI,GenBank,在用时最好先下载安装有道词典,因为是英文网站,不容易懂,专业名词也太多!不要怕,万事开头难!好好准备,入了门就好了!

这种最基本的东西没必要求论文啊,自己随便写写就好了,用个DNAMAN,随便挑个基因,分分钟搞出来。再者没人会拿这种东西单独去发一篇论文吧?这点东西根本不够资格,只够在某篇论文里的两句话的分量。

生物信息学毕业论文好写吗

生物信息学推荐系统设计关键词:推荐系统;生物信息学推荐系统(RecommenderSystem)[1]是个性化信息服务的主要技术之一,它实现的是“信息找人,按需服务”;通过对用户信息需要、兴趣爱好和访问历史等的收集分析,建立用户模型,并将用户模型应用于网上信息的过滤和排序,从而为用户提供感兴趣的资源和信息。生物信息学(Bioinformatics)[2,3]是由生物学、应用数学和计算机科学相互交叉所形成的一门新型学科;其实质是利用信息科学的方法和技术来解决生物学问题。20世纪末生物信息学迅速发展,在信息的数量和质量上都极大地丰富了生物科学的数据资源,而数据资源的急剧膨胀需要寻求一种科学而有力的工具来组织它们,基于生物信息学的二次数据库[4]能比较好地规范生物数据的分类与组织,但是用户无法从大量的生物数据中寻求自己感兴趣的部分(著名的生物信息学网站NCBI(美国国立生物技术信息中心),仅仅是小孢子虫(Microsporidia)的DNA序列就达3399种),因此在生物二次数据库上建立个性化推荐系统,能使用户快速找到自己感兴趣的生物信息。特别是在当前生物信息数据量急剧增长的情况下,生物信息学推荐系统将发挥强大的优势。1推荐系统的工作流程应用在不同领域的推荐系统,其体系结构也不完全相同。一般而言,推荐系统的工作流程[5]如图1所示。(1)信息获取。推荐系统工作的基础是用户信息。用户信息包括用户输入的关键词、项目的有关属性、用户对项目的文本评价或等级评价及用户的行为特征等,所有这些信息均可以作为形成推荐的依据。信息获取有两种类型[6],即显式获取(Explicit)和隐式获取(Implicit),由于用户的很多行为都能暗示用户的喜好,因此隐式获取信息的准确性比显式高一些。(2)信息处理。信息获取阶段所获得的用户信息,一般根据推荐技术的不同对信息进行相应的处理。用户信息的存储格式中用得最多的是基于数值的矩阵格式,最常用的是用m×n维的用户—项目矩阵R来表示,矩阵中的每个元素Rij=第i个用户对第j个项目的评价,可以当做数值处理,矩阵R被称为用户—项目矩阵。(3)个性化推荐。根据形成推荐的方法的不同可以分为三种,即基于规则的系统、基于内容过滤的系统和协同过滤系统。基于规则的推荐系统和基于内容过滤的推荐系统均只能为用户推荐过去喜欢的项目和相似的项目,并不能推荐用户潜在感兴趣的项目。而协同过滤系统能推荐出用户近邻所喜欢的项目,通过用户与近邻之间的“交流”,发现用户潜在的兴趣。因此本文所用的算法是基于协同过滤的推荐算法。(4)推荐结果。显示的任务是把推荐算法生成的推荐显示给用户,完成对用户的推荐。目前最常用的推荐可视化方法是Top-N列表[7],按照从大到小顺序把推荐分值最高的N个事物或者最权威的N条评价以列表的形式显示给用户。2生物信息学推荐系统的设计综合各种推荐技术的性能与优缺点,本文构造的生物信息学推荐系统的总体结构如图2所示。生物信息学推荐系统实现的主要功能是在用户登录生物信息学网站时,所留下的登录信息通过网站传递到推荐算法部分;推荐算法根据该用户的用户名从数据库提取出推荐列表,并返回到网站的用户界面;用户访问的记录返回到数据库,系统定时调用推荐算法,对数据库中用户访问信息的数据进行分析计算,形成推荐列表。本系统采用基于近邻的协同过滤推荐算法,其结构可以进一步细化为如图3所示。算法分为邻居形成和推荐形成两大部分,两部分可以独立进行。这是该推荐系统有别于其他系统的优势之一。由于信息获取后的用户—项目矩阵维数较大,使得系统的可扩展性降低。本系统采用SVD矩阵降维方法,减少用户—项目矩阵的维数,在计算用户相似度时大大降低了运算的次数,提高了推荐算法的效率。(1)信息获取。用户对项目的评价是基于用户对某一个项目(为表示简单,以下提及的项目均指网站上的生物物种)的点击次数来衡量的。当一个用户注册并填写好个人情况以后,系统会自动为该用户创建一个“信息矩阵”,该矩阵保存了所有项目的ID号以及相应的用户评价,保存的格式为:S+编号+用户评价,S用于标记项目,每个项目编号及其评价都以“S”相隔开;编号是唯一的,占5位;用户评价是用户点击该项目的次数,规定其范围是0~100,系统设定当增加到100时不再变化。这样做可防止形成矩阵时矩阵评价相差值过大而使推荐结果不准确。(2)信息处理。信息处理是将所有用户的信息矩阵转换为用户—项目矩阵,使用户信息矩阵数值化,假设系统中有M个用户和N个项目,信息处理的目的就是创建一个M×N的矩阵R,R[I][J]代表用户I对项目J的评价。(3)矩阵处理。协同过滤技术的用户—项目矩阵的数据表述方法所带来的稀疏性严重制约了推荐效果,而且在系统较大的情况下,它既不能精确地产生推荐集,又忽视了数据之间潜在的关系,发现不了用户潜在的兴趣,而且庞大的矩阵增加了计算的复杂度,因此有必要对该矩阵的表述方式做优化,进行矩阵处理。维数简化是一种较好的方法,本文提出的算法应用单值分解(SingularValueDecomposition,SVD)技术[8],对用户—项目矩阵进行维数简化。(4)相似度计算。得到降维以后的用户矩阵US,就可以寻找每个用户的近邻。近邻的确定是通过两个用户的相似度来度量的。本文采用Pearson相关度因子[9]求相似度。(5)计算用户邻居。该方法有两种[10],即基于中心的邻居(Center-BasedNeighbor)和集合邻居(AggregateNeighbor)。本系统采用了第一种方法,直接找出与用户相似度最高的前N个用户作为邻居,邻居个数N由系统设定,比如规定N=5。(6)推荐形成。推荐形成的前提是把当前用户的邻居ID号及其与当前用户的相似度保存到数据库中,而在前面的工作中已找出各用户的邻居以及与用户的相似度,推荐形成部分只需要对当前登录用户进行计算。推荐策略是:对当前用户已经访问过的项目不再进行推荐,推荐的范围是用户没有访问的项目,其目的是推荐用户潜在感兴趣的项目;考虑到系统的项目比较多,用户交互项目的数量很大,所以只筛选出推荐度最大的N个项目,形成Top-N推荐集,设定N=5。3生物信息学推荐系统的实现生物信息学推荐系统的实现可以用图4来表示。数据库部分主要存储用户信息和项目信息,用SQLServer2000实现。数据访问层实现了与用户交互必需的存储过程以及触发器,也使用SQLServer2000,主要完成以下功能:初始化新用户信息矩阵;插入新项目时更新所有用户的信息矩阵;用户点击项目时更新该用户对项目的评价;删除项目时更新所有用户的信息矩阵。用户访问层主要涉及网页与用户的交互和调用数据访问层的存储过程,在这里不做详细的介绍。推荐算法完成整个个性化推荐的任务,用Java实现。(1)数据连接类DataCon。该类完成与SQLServer2000数据库的连接,在连接之前必须要下载三个与SQLServer连接相关的包,即、和。(2)数据操作类DataControl。该类负责推荐算法与数据库的数据交换,静态成员Con调用()获得数据库连接,然后对数据库进行各种操作。把所有方法编写成静态,便于推荐算法中不创建对象就可以直接调用。(3)RecmmendSource与CurrentUserNeighbor。这两个类作为FCRecommand类的内部类,RecmmendSource用于保存当前用户的推荐列表,包括推荐项目号和推荐度;CurrentUserNeighbor用于保存邻居信息,包括邻居ID号、相似度及其访问信息。(4)协同过滤推荐算法FCRecommand。该类实现了整个推荐算法,主要分为邻居形成方法FCArithmetic和推荐形成方法GenerateRecommend。下面给出方法FCArithmetic的关键代码:Matrixuser_item=();//获取用户—项目矩阵user_item=(user_item);//调用SVD降维方法Vectorc_uservector=newVector();//当前用户向量Vectoro_uservector=newVector();//其他用户向量Vectorc_user_correlate_vector=newVector();//当前用户与其他用户之间相似度向量for(inti=0;ifor(intj=0;((i,j));//1.获得当前用户向量for(intk=0;();for(intl=0;((k,l));//2.获得其他用户的向量//3.计算当前用户与其他用户的相似度usercorrelativity=(c_uservector,o_uservector);(usercorrelativity);}//4.根据当前用户与其他用户的相似度,计算其邻居(i,c_user_correlate_vector);}根据邻居形成方法FCArithmetic,可以得到每个用户的邻居。作为测试用例,图6显示用户Jack与系统中一部分用户的相似度,可以看出它与自己的相似度必定最高;并且它与用户Sugx访问了相同的项目,它们之间的相似度也为1,具有极高的相似度。4结束语在传统推荐系统的基础上,结合当前生物信息学网站的特点,提出一个基于生物信息平台的推荐系统,解决了传统生物信息网站平台信息迷茫的缺点,为用户推荐其感兴趣物种的DNA或蛋白质序列。优点在于协同过滤的推荐算法能发现用户潜在的兴趣,能促进生物学家之间的交流;推荐算法的邻居形成与推荐形成两部分可以单独运行,减少了系统的开销。进一步的工作是分析生物数据的特点及生物数据之间的关系,增加用户和项目数量,更好地发挥推荐系统的优势。参考文献:[1]PAULR,[J].CommunicationsoftheACM,1997,40(3):56-58.[2]陈新.生物信息学简介[EB/OL].(2001)..[3]林毅申,林丕源.基于WebServices的生物信息解决方案[J].计算机应用研究,2005,22(6):157-158,164.[4]邢仲璟,林丕源,林毅申.基于Bioperl的生物二次数据库建立及应用[J].计算机系统应用,2004(11):58-60.

哪个专业的博士大论文都不好完成,需要好几个创新点的。但是以我做生信的经验,生信方向只要有系统的做,就很容易完成大论文。有系统的做是你一直做一个方向,用不同的方法研究一个内容,而不是一会研究蛋白质一会研究RNA这样跳来跳去的。

不知道,生物信息学,比较难

应该可以吧。。。

实验研究论文难写吗

对于很多也毕业生来说,最头疼的就是写毕业论文和毕业成果展示,建议找六月雪毕业设计网,通过极高

据学术堂了解,对于掌握论文写作方法的同学来说,写论文一点也不难,对于那些写作能力不高的同学来说,写论文就很难,下面学术堂整理了一份论文写作的方法,供大家进行参考:1、立意:明确标题,确定核心,精简,才能继续写论文。2、收集:扩大知识面,阅读大量书籍,搜集要广泛,为写论文提供各种思路。3、调查:围绕论文的内容进行相关的调查,集合多方面的线索,为你的论文增添新鲜元素。4、实验:有的论文需要进行实验才能证明论文的真实性可行性,实验不可避免。5、文献:书籍中有大量的文献能够为论文提供更好的引证,使用时需要标明出处等信息。如果认识相关学者也可请教这方面的知识。6、结论:结尾论文需要写上证明的结论,这篇论文就完成了。交给老师吧。

论文实验写作框架: 1、引言:要求交待清楚此项实验的缘由、目的和重要性。其中包括做的是什么实验?为什么要做这个实验?问题是怎样提出来的?有什么理论和实践的依据?到底要解决什么问题?前人和他人已做过哪些工作?尚有哪些问题还未得到最终取得的结果,有哪些拓展、突破和创造性的成果等。这部分要写得概括精炼,条理清楚。上述内容不必全写。视需要而定。在引言里,既要客观、公正地评述前人在这方面所做的工作,又不要过多地引用和堆砌前人论文的内容。 2、正文: (1)实验原理:简要说明实验所依据的基本原理,实验方案、实验装置的设计原理等。 (2)实验装置和方法:将选用的材料、实验装置和实验方法一一加以介绍,以便他人能够据此重复实验。 (3)实验过程:主要说明制定的实验方案和选择的技术路线,以及实验的具体操作步骤,还要说明实验过程中试验条件的变化因素及其依据等。 (4)实验结果与分析:这是论文的核心部分。实验成败由此判断,一切推理由此汇出,所以应该充分说明,并采用表格、图解、照片等附件。这些附件在这里能起到节省篇幅和帮助读者理解的作用。 3、结语:实验论文最终的、总体的结论,回答从实验结果本身概括或归纳出来的判断和评价。结论是全篇论文的精髓,应通过实验所获得的创造性成果和独创的见解在结论中作如实表述。作结论时,要抓住本质,突出中心,揭示事物内在的联络;用词要恰如其分,留有余地,既不能把问题说得模棱两可,又不要说得太死、太大、太绝对。实验结果富有成效,仅仅是指实验过程中人为所创造的条件而言的,在推广应用时,必然要受到这种或那种条件的限制,因而在做结论时,应充分考虑各种主客观因素,切忌不可将实验室的成效等同于实际生产中的成效。结论的文字要准确、鲜明、精炼,不要复述前面的结果和讨论,又要与引言相呼应,与正文紧密联络,才能作出充分和合乎逻辑的推理与判断,作出结论才能令人信服。

在阅读教学中,学生的学习大体可分为两种:独立学习--解决现有发展区的问题,即学生通过自己努力能够独立加以解决的问题;合作学习--解决最近发展区的问题,即学生经过个人努力,无法独立解决的问题。其中,学生可以独立解决的问题,师则不讲,让学生在自读自悟中完成,而学生需要合作才能解决的问题,除了教师的适当点拔外,让学生自由地寻找学习的伙伴,自由地选择探疑的方式。 在阅读教学中,我常常是让问题从学生中来,又回到学生中去,除了那些在教师的引导下,学生运用已有知识通过读书、思考、讨论自己能解决的问题外,不能解决的问题则可以是“你一言、我一语”全班同学群策群力,当然,也可以让学生自由结合,形成学习小组,自由选择解疑办法,如:读书解疑、实验解疑、讨论解疑、图示解疑、联络实际解疑等,学生爱用哪种,自由选择不加限制,之后让学生自由发表对有关问题的理解和独特的创造性的见解,从而使学生的解疑能力得到提高,创新能力得到培养。

1、实验目的 (国内外研究现状) 2、理论依据 (研究意义) 3、实验物件、方案及手段 (研究方法,技术方案,可行性分析) 4、实验结果总结

文段在内容上:以中心、意思相联络(思想感情)来答 在结构上:总分总 文段在开头:总起全文 文段在中间:承上启下 文段在结尾:总结全文或照应主题或首尾呼应。

实验题目:(如菠萝蛋白酶的提取) 一、实验目的和要求 二、实验原理 三、实验仪器和用品(略写) 四、实验材料和试剂的配制(略写) 五、实验步骤(略写) 六、实验结果 七、资料处理 八、实验分析 还需要更详细么?

実験室 じっけんしつ jikkensitsu 己肯西次

标题 简介(摘要) 前言(绪论) 实验正文 实验资料分析 结论 参考文献 正文应该包括 实验仪器 化学药品 完整的实验步骤 以及实验资料 实验样品图片等等

1、首先要有良好的场上洞察能力,能够做到该传球的时候传,不该传的时候不瞎传。 2、其次是要多练习突破的能力,因为一旦在外围传不出球的时候可以选择突破进去后再分球或者得分。 3、必须要练好基本功,比如说突破,运球,过人等,没有好得基本功,就算身体再好也没用,因为不会灵活运用技术,又怎么能够传好球,组织好进攻。 4、要有一个冷静的心态,因为组织后卫是发起全队进攻的人,是十分重要的,进攻能不能有效,往往取决于组织后卫这个环节,所以,遇到夹击或者对方防守很严时,一定不要慌张,要想办法冲过去。 5、身为组织后卫一定不能太黏球,有好的传球机会就一定要传,切勿逞英雄独来,要时刻记住自己的位置是组织后卫,是负责传球和组织进攻的,而不是主要来得分,这一点是十分重要的。

这个实验资料的话, 那么就要根据具体实验写的, 这个你得出的差异, 以及安全性, 写进去就可以了!

在毕业论文的写作过程中,指导教师一般都要求学生编写提纲。从写作程式上讲,它是作者动笔行文前的必要准备;从提纲本身来讲,它是作者构思谋篇的具体体现。所谓构思谋篇,就是组织设计毕业论文的篇章结构。。。其实这个并不难写的,我可以给你参考

论文呢也是有很多注意的地方的。

1. 研究背景——理论背景和实际背景 研究背景指的是为什么选择这个题目,理论背景指的是这个题目的主要概念是什么,实际背景指的是这个题目在现实中的应用主要是什么。 理论背景的句式 XX指的是……(概念),在XX维度下的分类包括……(分类),具有……的影响和作用(意义),常用于……领域(应用范围),对……有直接关联(和其他概念的关系和主体范畴地位),拥有一定的理论研究价值。 2.研究意义——理论意义和现实意义——研究背景的另一重阐述(精神一样,换种说法) 现实意义的句式: 本论文针XX的现状进行梳理、分析影响因素,探究解决方法途径,有利于明晰当前XX的实际情况,找到问题后面的原因和影响因素,帮助形成XX系统,从而建立起XX队伍,有利于XX整体建设,促进XX。 此外,XX也直接关系着……。本研究通过寻求影响XX的因素,有助于消弭负面的,促进……的提高,指出……的问题,帮助……的优化与发展。 3. 国内外研究现状 可以分为评述和列述两种模式。 列述简单,就xx指出/或认为……(去google学术或百度学术搜近五年或近三年的学术成果,改写摘要就可以)。 评述指的是归纳,这个领域学者们从XXX维度和XX角度提出看法,XX和XX认为……但XX提出了不同的看法……诸如此类。 国外研究现状用bing学术或google学术搜英文关键词看摘要即可。 4.研究内容和研究方法 研究内容:针对……问题,从……层面探究……分析……指出……认为……以期为……提出意见和看法,指出策略和途径。 研究方法(不同老师倾向的阐述词语不同,事先看一下老师的喜好) (1)文献法 (2)文本分析法 (3)访谈法 (4)问卷调查法 5.参考文献(国家要求是五年内的研究成果,有的学校要求三年内)

生物信息学论文怎么写

空手套白狼,实现有难度。你要熟悉各种生物的基因组,要分析能力很强才行。

应该可以吧。。。

不知道,生物信息学,比较难

最好先阅读几篇相应文章和相今似的论文,比如你的课题是油菜,你可以搜有关其他物种如小麦的。根据论文写作步骤制定实验计划。要练习使用一些常用软件,如NCBI,GenBank,在用时最好先下载安装有道词典,因为是英文网站,不容易懂,专业名词也太多!不要怕,万事开头难!好好准备,入了门就好了!

相关百科
热门百科
首页
发表服务